Ubuntu上での Julia の環境構築

Juliaデータサイエンス―Juliaを使って自分でゼロから作るデータサイエンス世界の探索

作者: Anshul Joshi,石井一夫,岩中公紀,太田博三,大前奈月,兼松正人,古徳純一,菅野剛,高尾克也,中村和敬
出版社/メーカー: エヌ・ティー・エス
発売日: 2017/09/26
メディア: 単行本（ソフトカバー）
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はじめに

Ubuntu 16.04 LTS に，Julia 0.6.3を導入しました．
PyCallで呼び出すPythonは，Anacondaの仮想環境にあるPythonに設定しました．

環境構築

インストール方法は様々な方法*1が紹介されていますが，
今回は，バイナリ版をダウンロードしてインストールする方法を取りました*2．

# Juliaのバイナリを保存してあるフォルダに移動した後，解凍
tar -xzf julia-0.6.3-linux-x86_64.tar.gz
sudo ln -s <where you extracted the julia archive>/bin/julia /usr/local/bin/julia

Jupyter Notebook で使えるようにするまで

パスの設定などは，以下を参考にしました．
Juliaで用いるPythonを，既に構築してあるAnacondaの仮想環境につなげます*3．

ここで，パスとしてpython3を指定するのが大事*4

julia> Pkg.init()
julia> Pkg.add("PyCall")
julia> using PyCall
julia> ENV["PYTHON"]="/home/<user name>/anaconda3/bin/python3"
julia> rm(Pkg.dir("PyCall","deps","PYTHON"))
julia> Pkg.build("PyCall")

一旦，juliaを抜けてから*5，

$ conda create -n env_jl python
$ export CONDA_JL_HOME="/home/<user name>/anaconda3/envs/env_jl"
$ julia -e 'Pkg.build("Conda")'

もう一度，Juliaに入って，

julia> Pkg.add("IJulia")
julia> Pkg.add("PyPlot")
julia> Pkg.update()

これで出来ました．

参考資料

脚注

*1:インストール方法はこちらを参考にさせて頂きました． Platform specific instructions for installing Julia heine98.hatenablog.com

*2:Juliaの公式サイト https://julialang.org/downloads/ からダウンロードしました

*3:hotoke-x.hatenablog.com

*4:当初，"/home//anaconda3/bin/python" で指定していたところ，あとでPyCallを実行する段になって，環境内のPython3が勝手にPython2に書き換えられるという事態が発生してしまいました．参考↓ sugar01.hatenablog.com

*5:このあたりは，こちら↓を参考にさせて頂きました． qiita.com

めっくろぐ

mechlog - メモ帳

Ubuntu上での Julia の環境構築

はじめに

環境構築

Jupyter Notebook で使えるようにするまで

参考資料

Julia のチュートリアル

使い方

そのほか参考にさせて頂いた資料

脚注